Liverpool tog ledningen i den 26:e minuten efter att Paul Anderson tagit emot en passning av Godwin Antwi på högerkanten, dribblat sig förbi två försvarare och satt bollen lågit intill stolpen.
Det dröjde sedan bara fyra minuter innan Roman Calliste dubblade ledningen efter att Runcornmålvakten kolliderat med en egen försvarare och lämnat målet öppet för Liverpoolanfallaren.
Neil Mellor som efter ett långt skadeuppehåll gjorde comeback med ett sent inhopp i reservlagsmatchen mot Manchester United för två veckor sedan spelade 90 minuter mot Runcorn och kunde två minuter före full tid göra 3-0 med ett mål som karakteriserar en målskytt.
Liverpool: Willis; Barragan, Raven, Antwi, O'Donnell; Hobbs, Anderson, Peltier, Mannix; Mellor, Calliste (Idrizaj 45).
Avb: Guthrie, Roberts, Smith, Roque.